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Parasites microbiens marins de l'Atlantique Nord
Développement d'outils génétiques qui permette au parasite protozoaire de mollusque, Perkinsus, de devenir un système génétiquement traçable.
Axe 1: Développement d'outils génétiques pour le dépistage en culture de laboratoire de la transformabilité et de la manipulation des dinoflagellés et des parasites.
"An Agar-Based Method for Plating Marine Protozoan Parasites of the Genus Perkinsus"
Cold et al., 2016, Plos One
Objectif principal : Le genre Perkinsus comprend des parasites protozoaires de mollusques responsables de pertes dans l'industrie de l'aquaculture et entravant la reconstitution des bancs naturels de mollusques dans le monde entier, et il constitue un taxon clé pour comprendre les adaptations du parasitisme intracellulaire. La capacité à propager le parasite en milieu liquide, en l'absence de l'hôte, a été cruciale pour améliorer la compréhension de sa biologie ; cependant, des techniques alternatives pour cultiver le parasite sont nécessaires pour explorer d'autres aspects fondamentaux du parasitisme intracellulaire de Perkinsus spp.
Résultats : Nous avons optimisé un milieu DME : Ham's F12-5% FBS- contenant de la gélose solide pour l'ensemencement de Perkinsus marinus. Nous avons testé l'adéquation de cette méthode pour plusieurs applications, dont les suivantes : 1) Sous-clonage d'isolats de P. marinus : des colonies discrètes de P. marinus ont été obtenues à partir de plaques de gélose DME : Ham's F12-5% FBS- 0,75%, qui ont pu être propagées en milieu liquide ; 2) Sous-clonage de Perkinsus mediterraneus MOE[MOE] : GFP par ensemencement des cultures sur des plaques ; 3) Sensibilité chimique : L'infusion des plaques de gélose DME : Ham's F12-5% FBS- 0,75% avec du triclosan a entraîné l'inhibition de la propagation du parasite de manière dose-dépendante. Dans l'ensemble, notre méthode d'ensemencement pourrait devenir un outil clé pour l'étude de divers aspects de la biologie de Perkinsus spp., pour le développement de nouveaux outils moléculaires et pour des applications biotechnologiques.
"Genetic tool development in marine protists: emerging model organisms for experimental cell biology"
Faktorová et al., 2020, Nat. Methods
Objectif principal : Des écosystèmes microbiens diversifiés sont à la base de la vie en mer. Parmi ces microbes se trouvent de nombreux eucaryotes unicellulaires qui couvrent la diversité de l'arbre de vie eucaryote. Cependant, la traçabilité génétique a été limitée à quelques espèces, qui ne représentent pas la diversité eucaryote ou les taxons pertinents pour l'environnement. Nous présentons ici le développement d'outils génétiques chez une série de protistes provenant principalement d'environnements marins.
Résultats : Nous présentons des preuves de la livraison et de l'expression d'ADN étranger chez 13 espèces jamais transformées auparavant et de l'avancement des outils pour huit autres espèces, ainsi que des raisons potentielles pour lesquelles la transformation de 17 autres espèces testées n'a pas été réalisée. Nos ressources en matière de manipulation génétique permettront de mieux comprendre les formes de vie eucaryotes ancestrales, la biologie cellulaire générale des eucaryotes, la diversification des protéines et l'évolution des voies cellulaires.
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