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Maladie Hollandaise de L'Orme
Approches transcriptomiques et fonctionnelles pour étudier les interactions hôte-pathogène afin de dévoiler la Maladie Hollandaise de l'Orme
Axe 1: Génomique fonctionnelle à grande échelle des agents de la graphiose de l'orme.
"Unraveling the Transcriptional Features and Gene Expression Networks of Pathogenic and Saprotrophic Ophiostoma Species During the Infection of Ulmus americana"
de Oliveira et al., 2024, Microbiol. Spec.
Objectif principal : Ophiostoma est un genre de champignons cosmopolites appartenant à la famille des Ophiostomataceae et comprenant les agents pathogènes responsables de deux pandémies dévastatrices de la maladie hollandaise de l'orme (MHO). Comme les mécanismes d'action des agents de la MHO restent obscurs, nous avons réalisé la première étude transcriptomique comparative incluant des souches représentatives des trois espèces d'Ophiostoma responsables de la MHO, ainsi que de l'espèce saprotrophe phylogénétiquement proche, Ophiostoma quercus.
Résultats : Nous avons observé des profils de transcriptome spécifiques à chaque taxon, les transcriptomes de l'espèce saprotrophe O. quercus étant significativement différents des transcriptomes des pathogènes de la MHO. Pour les taxons pathogènes analysés, les variations du transcriptome n'étaient pas associées à des relations phylogénétiques. Nous avons observé des différences marquées entre les transcriptomes des Ophiostomes et identifié plusieurs gènes candidats qui pourraient être impliqués dans l'aptitude parasitaire des pathogènes de la MHO.
"Exploration of the transcriptional characteristics and gene expression networks of Ulmus americana during infection by pathogenic and saprotrophic Ophiostoma species."
de Oliveira et al., 2025, sera soumis au Journal of Experimental Botany
Objectif principal : L'un des principaux objectifs du projet était de fournir une évaluation à l'échelle du génome des mécanismes moléculaires qui sous-tendent le niveau élevé de résistance observé chez les ormes à la maladie hollandaise de l'orme (MHO).
Résultats : Nous présentons ici les transcriptomes de l'hôte en réponse à ces souches fongiques. En plus d'appliquer les tests statistiques habituels pour comparer les transcriptomes, nous avons analysé les interactions Ulmus americana - O. ulmi et U. americana - O. novo-ulmi au moyen de l'inférence de réseaux de cooccurrence (CoNet). Les transcriptomes de l'orme ont été significativement influencés par l'espèce et la lignée des pathogènes MHO qui avaient été inoculés.
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